La
acción gira en torno a Sora, un niño de 14 años que vive en Las Islas del
Destino con sus amigos Kairi y Riku (y namine). Los tres desean salir de ese
mundo en el que se encuentran, que ellos consideran (especialmente Riku) que es
una prisión para sus sueños de conocimiento y grandeza, así que deciden hacer
una balsa y se ponen manos a la obra; pero la noche antes del viaje una
tormenta oscurece las islas y aparecen unas criaturas llamadas los Sincorazón
(en inglés llamados heartless). Los tres amigos están separados en esos
momentos. Cuando Sora encuentra a Riku, el cual le tiende la mano al percibir
su presencia, se percata de que su amigo está rodeado por una sombra, en la
cual desaparece en pocos segundos. Poco después un monstruo gigante nace a
partir de la sombra de Sora, llamado Lado Oscuro, y el chico no puede
derrotarlo, y tampoco tiene donde huir; repentinamente un arma blanca aparece
en la mano de Sora, la llave espada (en inglés keyblade), con la cual puede
combatir a todos los Sincorazón e intentará abrir la puerta hacia la luz.
La
llave espada es el arma principal del videojuego; a quien la posea se le llama
el Portador de la Llave; sus portadores son Sora, el rey Mickey y, por breves períodos
de tiempo, Riku. La llave de esta arma sirve para cerrar las cerraduras de los
mundos para que no entren más Sincorazón y para tener la posibilidad de
herirlos, ya que son seres creados a partir de la oscuridad de los corazones y
no pueden ser destruidos fácilmente.
Su
mundo es entonces engullido por la oscuridad, y Sora despierta en Ciudad de
Paso, un mundo en el que se encuentra con Aeris, Squall Leonhart, que prefiere
ser llamado León hasta que su mundo reaparezca, y Yuffie. Más tarde se encuentra
con el Pato Donald y Goofy, a los cuales se le encargó la importante misión
buscar al Portador de la Llave para después reunirse con su rey, Mickey Mouse.
Y así empieza una larga e inolvidable aventura a través de mundos basados en
películas de Disney y otros de la serie de videojuegos Final Fantasy. A lo
largo de su viaje Sora va sellando las cerraduras del corazón de los mundos,
evitando así la destrucción de éstos. A su vez, Riku, creyendo que Sora no se
preocupa por el destino de su amiga Kairi, se alía con Maléfica, la cual lidera
una organización de villanos de Disney. El fin de esta organización es capturar
a siete doncellas de corazón puro, las llamadas Princesas del Corazón, para
abrir la puerta al Reino de los Corazones (Kingdom Hearts en inglés), fuente de
poder y sabiduría absolutos.
Finalmente,
Sora y los demás consiguen llegar a Bastión hueco, cuartel general de los
malos, en donde Sora se enfrenta a Riku, éste le revela que él también es un
portador de la llave espada y le arrebata a Sora la suya para demostrarle quién
es el verdadero «elegido». Sora, más tarde, consigue recuperar la llave espada
al demostrar que su corazón es mucho más fuerte que el de Riku, el cual, ya
derrotado, acepta la oferta de un misterioso encapuchado, quien le ofrece un
gran poder para derrotar a Sora. Riku aparece de nuevo ante Sora y sus amigos
con una llave espada que abre los corazones, y la usa contra Maléfica, que por
fin obtiene el verdadero poder de la oscuridad y se transforma así en un
terrible dragón negro.
Sora se
enfrenta de nuevo a Riku, pero esta vez no es verdaderamente él; sino Ansem, el
científico que investigó sobre los Sincorazón (lo que reflejó en los «Informes
de Ansem»), ocupando el cuerpo de Riku. Ansem desea ser parte de lo que él cree
que es la primera fase de la existencia, la oscuridad de la que él supone que
está formado el Reino de los Corazones. Kairi resulta ser una de las Princesas
del Corazón, y el suyo está unido al de Sora aunque estén separados, porque el
corazón de Kairi siempre perteneció a Sora. Sora, Donald y Goofy derrotan a
Ansem en la forma de Riku, del que obtuvo anteriormente el cuerpo. Para liberar
el corazón de Kairi, Sora se clava a sí mismo la llave espada de Riku y pierde
el corazón (que es también el de Kairi), pero Kairi se recupera y también se
liberan las otras Princesas del Corazón. De esta manera el camino al Reino de
los Corazones fue abierto.
Ahora
Sora, al no tener corazón, se transforma en un Sincorazón que intenta proteger
a Kairi, y ésta, reconociendo a su amigo, lo hace regresar de la infinita
oscuridad y vuelve a ser Sora (en Kingdom Hearts II se explica que es aquí
donde se crea el incorpóreo de Sora, Roxas). Huyen de Bastión Hueco debido a la
cantidad de Sincorazón que surgen de allí. Vuelven más tarde para sellar la
cerradura y viajar al Fin del Mundo, donde está el Reino de los Corazones y
tiene lugar la batalla final contra Ansem.
Cuando
la luz de la que está hecha el Reino de los Corazones derrota a Ansem, la
puerta amenaza con soltar a millones y millones de Sincorazón en el Universo.
Sora, Donald y Goofy intentan cerrar la puerta, pero su fuerza no es
suficiente. Riku, el auténtico, les ayuda a cerrarla por el otro lado, pero él
y el Rey Mickey tienen que quedarse dentro. Mickey y Sora combinan sus llaves
espadas para cerrar la puerta del Reino de los Corazones. Antes de cerrarse la
puerta Riku le pide a Sora que cuide de Kairi. El reencuentro de Kairi y Sora
es muy corto, ya que la reconstrucción de Las Islas del Destino los separa.
Sora promete a Kairi que regresará con ella, y se marcha con Donald y Goofy a
buscar a Riku y al rey Mickey. Es entonces cuando llegan al Castillo del
Olvido, donde la historia continúa en el videojuego Kingdom Hearts: Chain of
Memories.
El juego comienza con Roxas, un chico de quince años que
aparentemente vive una vida normal en Villa Crepúsculo con sus amigos. Mientras
investiga con sus amigos unos extraños robos, descubre a unas criaturas que lo
siguen llamados incorpóreos y a una misteriosa chica llamada Naminé. Tras un
encuentro con Axel, un miembro de la Organización XIII, Roxas descubre que solo
es el cascarón que se formó cuando Sora se convirtió en sincorazón (al intentar
liberar el corazón de Kairi). Al descubrir a Sora en la cápsula en la que se
quedó dormido un año, DiZ, un extraño personaje, le dice que es su destino
unirse a Sora. Roxas acepta unirse a él diciendo que sus vacaciones terminaron,
Sora despierta y junto a Donald y Goofy continúan su búsqueda de el Rey y Riku,
sin recordar nada de lo que paso antes de quedarse dormido. Volvió a recordar a
Kairi olvidando completamente a Naminé, mientras que Kairi (un año mayor)
recuerda vagamente a sus amigos. Sora vuelve a recorrer los mundos de Disney
volviendo a sellar las cerraduras que se habían abierto. Durante su aventura
encuentran al Rey Mickey y a Riku, pero la organización Xlll secuestra a Kairi
junto con Pluto. Naminé logra salvarla y esta desaparece volviéndose a unir a
Kairi. 